不銹鋼發酵罐是用于食品、生物、化工、制藥等行業中物料的發酵與反應，染菌是生產上非常重要問題。輕度染菌會影響到本批發酵產品的單位和收率，還可能會為下批生產埋下繼續染菌的禍根，嚴重的染菌除嚴重影響產品產量和質量外，可能造成生產不能有序進行或無法進行不銹鋼發酵罐染菌的原因有物料、設備、蒸汽(空氣)和人為等因素。

不銹鋼發酵罐染菌的物料原因：物料在存放中會受到擠壓結塊，不能全面消毒。

不銹鋼發酵罐染菌的設備原因：罐體消毒不徹底的影響，罐內部件因素造成染菌，罐內管路因素造成染茵。發酵罐內管道走向、分布是否合理，會影響消毒質量，罐體外設備因素造成染菌：閥門及管路。

不銹鋼發酵罐染菌的蒸汽(空氣)原因：蒸汽一直不穩定，時有過熱和不飽和情況產生，會造成消毒工作不能正常進行，滅菌效果不好，染菌機會倍增。 空氣管路的清潔鑄鐵管道帶銹會損害了各級過濾器膜芯，發酵水平受限，染菌幾率增加。

不銹鋼發酵罐染菌的人為原因：人為因素在染菌上占有一定的比重，消毒不當反而會增加了染菌幾率或檢修罐閥時不精心造成泄露而染菌，所以消毒工作要求員工精心細致地操作，才能盡量的避免罐體染菌的可能。